恭亲王与慈禧慈安两宫太后强强联合，一举击败了肃顺为首的“顾命八大臣”。这就是历史上著名的辛酉政变，这次胜利为慈禧慈安两宫太后赢得了“垂帘听政”的特权，更为恭亲王赢得了无尚的荣耀和权力。恭亲王被封为议政王，军机要务一人独管理。
辛酉政变后，慈禧意欲独揽朝政，而奕没有把深宫中的两个嫂子---两个女人，放在眼里，想“挟天子以令诸侯”。此时，宫中呈现出了两雄并立之势，在权力欲的诱惑下“同盟”已经出现了裂痕。
奕自从掌握军政大权以后，一面不断取媚于外夷，一面全力围攻太平天国的起义军，终于攻陷天京，将一场轰轰烈烈的农民起义镇压了下去。恭亲王“安外攘内”的策略让军机处的人对他都很恭维，洋人对他也很赏识，他在得意中也不再把慈禧这个“女流之辈”放在眼里。
而慈禧是个权力欲极强的女人，她绝不会容忍奕独揽大权，奕越是成功，她就越是记恨，终于产生了要剪除奕的决心。而此时的恭亲王并没有感到危险，他在得意之时的言谈举止，任人行事未免粗疏而授人以把柄。
同治四年（1865年），慈禧终于等来了恭亲王出错的时机。不过，这一次并非恭亲王出错，而是本非安分之徒的新复翰林院编修署日讲官蔡寿祺看准了恭亲王，慈禧矛盾日渐尖锐，颇有几分以头颅为赌注的政治流氓气味，切中慈禧而上奏参劾恭亲王。这一参劾，触发了慈禧与恭亲王围绕权利分配的宫廷斗争。蔡寿祺的参劾共八条，列举了奕贪墨、骄纵、揽权、徇私四大罪状。但是，蔡寿祺所列举恭亲王的四大罪状均无实际根据可查，全是由“疑虑”、“猜疑”、“疑惑”而顶，却又极富煽动性。所以，蔡寿祺的奏折一上，两宫震怒，诸臣惶惶，恭亲王虽气愤而不知所措。
关于蔡寿祺参劾恭亲王一案，在李慈铭的《越缦堂日记》。王]运的《祺祥故事》都有生动的描述。而李慈铭，王]运二人皆为当时权贵的座上客，故其记载应该是比较真实，绝非一般野史那样的捕风捉影。据《越缦堂日记》记载：
传是日王（即议政王恭亲王）进见，太后谓王曰：“有人劾汝!”示以折。王不谢，固问：“何人？”慈禧言：“蔡寿祺。”王失声曰：“蔡寿祺非好人!”欲逮问之。两宫怒甚，即召见大学士周培祖、瑞常、吏部尚书朱风标、户部侍郎吴廷栋、刑部侍郎王发桂、内阁学士桑春荣、殷兆铺等，垂泪谕臣曰：“王植党擅政，渐不能堪，欲重治王罪!”
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